巴南区中医院输血科，于2021年独立成科。现已从功能单一的血库发展为集储供血、输血检验、输血治疗多种职能为一体的综合性科室。输血科主要工作包括：输血相容性实验室检测、输血感染疾病免疫学实验室检测、输血疗效与风险评估、输血不良反应的实验室检测及评估、血细胞分离治疗、自体输血、血液出入库管理、临床输血中血液成分合理应用指导、临床输血会诊等。除常规项目外，输血科还开展血小板抗体检测、Rh五种抗原检测等项目，为临床用血提供更全面依据。加强临床合理用血监管，持续改进提高合理用血率。输血科现有业务用房约100平方米，按照《重庆市医疗机构输血科基本标准》标准，设有输血相容性检测实验室、血型参比实验室、艾滋病筛查实验室、储发血室、治疗室等。